ОМНПрограммирование Programming and Computer Software

  • ISSN (Print) 0132-3474
  • ISSN (Online) 3034-5847

Нейросетевой метод детектирования размытия на гистологических изображениях

Код статьи
10.31857/S0132347424030075-1
DOI
10.31857/S0132347424030075
Тип публикации
Статья
Статус публикации
Опубликовано
Авторы
Том/ Выпуск
Том / Номер выпуска 3
Страницы
67-74
Аннотация
В работе рассматривается задача обнаружения размытых областей на полнослайдовых гистологических изображениях высокого разрешения. Предлагаемый метод основан на использовании нейронного оператора Фурье, обучаемого на результатах двух одновременно использованых подходов: обнаружения размытия с помощью многомасштабного анализа коэффициентов дискретного косинусного преобразования и оценки степени резкости границ объектов на изображении. Эффективность алгоритма подтверждена на изображениях из наборов данных PATH-DT-MSU [1] и FocusPath [2].
Ключевые слова
гистология глубокое обучение область размытия нейронный оператор Фурье
Дата публикации
17.09.2025
Год выхода
2025
Всего подписок
0
Всего просмотров
20

Библиография

  1. 1. Khvostikov, A., Krylov A., Mikhailov I., Malkov P. Visualization and Analysis of Whole Slide Histological Images // Lecture Notes in Computer Science. 2023. V. 13644. Р. 403–413.
  2. 2. Hosseini M., Zhang Y., Plataniotis K. Encoding visual sensitivity by maxpol convolution filters for image sharpness assessment // IEEE Transactions on Image Processing. 2019. V. 28. Р. 4510–4525.
  3. 3. Taqi S.A., Sami S.A., Sami L.B., Zaki S.A. A review of artifacts in histopathology // Journal of oral and maxillofacial pathology: JOMFP. 2018. V. 22. P. 279–287.
  4. 4. Priego-Torres B.M., Sanchez-Morillo D., Fernandez-Granero M.A., Garcia-Rojo M. Automatic segmentation of whole-slide H&E stained breast histopathology images using a deep convolutional neural network architecture // Expert Systems With Applications. 2020. V. 151. P. 113387.
  5. 5. Kanwal N., Perez-Bueno F., Schmidt A., Engan K., Molina R. The devil is in the details: Whole slide image acquisition and processing for artifacts detection, color variation, and data augmentation: A review // IEEE Access. 2022. V. 10. Р. 58821.
  6. 6. Janowczyk A. et al. HistoQC: an open-source quality control tool for digital pathology slides // JCO clinic. cancer informatics. 2019. V. 3. P. 1–7.
  7. 7. Albuquerque T., Moreira A., Cardoso J. Deep ordinal focus assessment for whole slide images // Proceedings of the IEEE/CVF ICCV. 2021. Р. 657–663.
  8. 8. Senaras C., Niazi M., Lozanski G., Gurcan M. DeepFocus: detection of out-of-focus regions in whole slide digital images using deep learning // PloS one. 2018. V. 13. Р. e0205387.
  9. 9. Kohlberger T., Liu Y., Moran M. et al. Whole-slide image focus quality: Automatic assessment and impact on ai cancer detection // Journal of pathology informatics. 2019. V. 10. Р. 39.
  10. 10. Wang Z., Hosseini M., Miles A., Plataniotis K., Wang Z. Focuslitenn: High efficiency focus quality assessment for digital pathology. MICCAI. Springer International Publishing, 2020. P. 403–413.
  11. 11. Kanwal N. et al. Are you sure it’s an artifact? Artifact detection and uncertainty quantification in histological images // Computerized Medical Imaging and Graphics. 2024. V. 112. P. 102321.
  12. 12. Faroughi S., Pawar N., Fernandes C. et al. Physics-guided, physics-informed, and physics-encoded neural networks in scientific computing // arXiv preprint. arXiv:2211.07377, 2022.
  13. 13. Li Q., Liu X., Han K., Guo C., Jiang J., Ji X., Wu X. Learning to autofocus in whole slide imaging via physics-guided deep cascade networks // Optics Express. 2022. V. 30. Р. 14319–14340.
  14. 14. Alireza Golestaneh S., Karam L. Spatially-varying blur detection based on multiscale fused and sorted transform coefficients of gradient magnitudes // Proceedings of ICPR. 2017. Р. 5800–5809.
  15. 15. Kumar J., Chen F., Doermann D. Sharpness estimation for document and scene images // Proceedings of ICPR. 2012. Р. 3292–3295.
  16. 16. Langelaar G.C., Setyawan I., Lagendijk R.L. Watermarking digital image and video data. A state- of-the-art overview // IEEE Signal processing magazine. 2000. V. 17. No. 5. Р. 20–46.
  17. 17. Shi J., Xu L., Jia J. Discriminative blur detection features // Proceedings of ICPR. 2014. Р. 2965–2972.
  18. 18. Yan Q., Xu L., Shi J., Jia J. Hierarchical saliency detection // Proceedings of ICPR. 2013. Р. 1155–1162.
  19. 19. Gastal E., Oliveira M. Domain transform for edge-aware image and video processing // ACM SIGGRAPH. 2011. Р. 1–12.
  20. 20. Ferzli R., Karam L.J. A no-reference objective image sharpness metric based on the notion of just noticeable blur (JNB) // IEEE transactions on image processing. 2009. V. 18. No. 4. Р. 717–728.
  21. 21. Назаренко Г., Насонов А., Крылов А. Метод поиска областей размытия на гистологических изображениях. Proceedings of the 33nd International Conference on Computer Graphics and Vision. М.: ИПМ им. М.В. Келдыша РАН, 2023. С. 598–608. https://doi.org/10.20948/graphicon-2023-620-632
  22. 22. Yuki Mochizuki Normalize image brightness. https://cvtech.cc/std/
  23. 23. Li Z., Kovachki N., Azizzadenesheli K., Liu B., Bhattacharya K., Stuart A., Anandkumar A. Fourier neural operator for parametric partial differential equations // arXiv preprint. arXiv:2010.08895, 2020.
QR
Перевести

Индексирование

Scopus

Scopus

Scopus

Crossref

Scopus

Высшая аттестационная комиссия

При Министерстве образования и науки Российской Федерации

Scopus

Научная электронная библиотека